Référentiel et table de correspondance pour les observations en élevage OBS

Table de référence des observations permettant l'interopérabilité et la valorisation des enregistrements des registres d'élevage.

La table proposée propose et permet de faire le lien entre :

• les termes français et anglais pour une observation relative aux animaux d'élevage (symptôme ou syndrome, diagnostic, analyse, autres observations physiologiques ou zootechniques,...),
• la codification SNOMED v3.5 et la codification SNOMED CT comprenant l'extension vétérinaire,
• la codification ICAR (1 <> 1),
• la codification utilisée au sein de Vet'Elevage (1 <> 1),
• la codification utilisée au sein de l'application SIEL (n -> 1).

La correspondance s'appuie sur un identifiant pivot unique (IDOBS) pérenne pour chaque terme.

Par observations usuelles il convient d'entendre les observations référencées ou proposées par les applications utilisatrices des référentiels cités. Si des observations usuelles utilisés dans les applications francophones sont manquantes ne pas hésiter à les signaler pour compléter la présente table de correspondance.

Les clés du fichier JSON et les colonnes du fichier excel sont les suivantes :

• "damijo" : date de création ou dernière mise à jour du champ
• "actif" : si vide, valeur active, si date celle-ci correspond à la date de fin d'utilisation de la valeur
• "idobs" : identifiant unique et pérenne du terme
• "syn" : niveau de synonymie : 1 - mot clé principal ; 2 - synonyme admis ; 3 - synonyme local ou issu d'un langage oral
• "snomed" : correspondance avec l'identifiant SNOMED v3.5 FR
• "snomedct" : correspondance avec l'identifiant SNOMED CT (SCTID)
• "loinc" : correspondance avec l'identifiant LOINC
• "icar" : correspondance avec l'identifiant ICAR (ICAR Code)
• "vetelevage" : correspondance avec l'identifiant VETELEVAGE
• "siel" : correspondance avec l'identifiant SIEL / MILKCLIC
• "name_fr" : terme en français
• "name_en" : terme en anglais

@Développeurs et éditeurs de logiciels, chercheurs et universitaires : Si vous souhaitez aller plus loin notamment en terme de valorisation des données, ce jeu de données est disponible en version complète utilisable dans un parser pour rendre significatif un jeu d'observations en élevage avec l'ensemble des tokens et leurs références diagnostiques spécifiques vétérinaires.